История мини-футбольного клуба «Мытищи» берет свой отсчет с 2002 года. Именно в тот год был создан футбольный клуб "Мытищи" и старт в новом сезоне взяли две команды - по классическому большому футболу и по мини-футболу.
Мини-футбольная команда провела свой первый матч 16 ноября 2002 года, добившись победы над ФК «Дмитров» в матче Второй лиги. Главным тренером мытищинцев стал Михаил Бондарев, тремя годами раннее, в качестве наставника сборной России по мини-футболу выигравший золото чемпионата Европы. В первом же сезоне «Мытищи» сумели заработать путёвку в Первую лигу, во втором — уже в Высшую лигу. Проведя там два сезона, мытищинцам удалось пробиться и в Суперлигу - элитный дивизион российского мини-футбола.
Таким образом, «Мытищи» начали сезон 2006-07 среди сильнейших команд России. В дебютном сезоне команда заняла предпоследнее место, сумев обогнать лишь петербургский «Политех». В следующем чемпионате, помимо петербуржцев, подмосковная команда опередила еще и уфимскую «Динамо-Тималь».
Более успешным стал для «Мытищ» сезон 2008-09, когда они заняли восьмое место, сумев занести в актив гостевую победу над чемпионом — «ВИЗ-Синарой». Однако восьмое место в том чемпионате и по сей является наивысшим достижением клуба из Подмосковья. В последние годы МФК «Мытищи» каждый сезон являются одним из претендентов на попадание в плей-офф, но, тем не менее, еще ни разу «Мытищи» в эту стадию не проходили.
Перед отчетным поединком мытищинцы находятся на 9 месте в турнирной таблице, отставая от идущего восьмым КПРФ всего на 1 очко. Лучший бомбардир команды на этом отрезке Паулиньо забил в 22 матчах 17 мячей.